在肉前里小怪里较为稀有的为染料怪物，在洞穴层里会出现胭脂虫，在地下苔原里则会生成青壳虫。在地下丛林会出现紫胶虫，在海洋里面则会出现乌贼与更为罕见的海蜗牛。这些小怪都是一定会掉落染料材料，虽然这些材料平时只会觉得占据着背包的空间，但是毕竟染料商并不会售卖，等到要用的时候不用着急去刷。在夜晚的丛林里还有可能会刷新出一种较为稀有的僵尸，名为骷髅博士，在所有的僵尸种类里都是血量最厚的一位，在击杀掉后会掉落考古帽。

在血月里会有两种稀有的僵尸变体，分别是僵尸新娘和僵尸新郎，它们的血量相较普通僵尸来说稍微高点，击杀会后掉落其身上穿着的服饰，例如婚纱、礼帽等。这两种僵尸有20%的血泪掉落概率，加上墓地里有概率刷新出来，反复刷还是不缺血泪的。血月期间变异的鱼怪是会在生命探测仪上显示出来的稀有怪，不会自动刷新出来，需要玩家在水域里面钓鱼才能出现。

在白天的时候世界两边可能会刷出哥布林侦察兵，它会掉落破布，可以用来制作出可召唤出特殊事件的哥布林战旗。想要刷新出该怪物的话，玩家就能将平台搭到海的边缘，能直接看到其刷出来的点位，且刷新速度比较快，较多的数量足够让玩家刷到破布。笨拙气球史莱姆刷新地带较为特殊，通常会在较高的太空处生成，当玩家气球打破后即可消灭，之后它会成为城镇NPC。虽然看起来像是气球，但是刷新方式和小怪是相同的。地狱的巫毒恶魔是稀有小怪，虽然刷新概率不算低，但是会出现在生命探测仪上。

地牢史莱姆也是较为常见的稀有怪，会掉落较为罕见的金钥匙，在探索地牢的时候看见就需要击杀。彩蛋事件中也会生成的稀有小怪金史莱姆，与粉史莱姆的机制一样，会以低概率替换史莱姆生成，攻击性与血量都偏高。区别是该怪物掉落的钱是小怪里最多的，击打时还会有爆金币特效。虽然金色的史莱姆不会在图鉴手册里面中出现，但是依旧会显示在探测仪上，不过需要在限定的彩蛋事件出现的时候才有概率刷新出来，如果运气不好错过了彩蛋，可能就看不见金史莱姆了。