口袋妖怪XY中的神兽包括封面神兽哲尔尼亚斯（X版限定）和伊裴尔塔尔（Y版限定），以及超梦、Z神基格尔德和关东三圣鸟（急冻鸟、闪电鸟、烈焰鸟）。这些神兽的获取方式与剧情进度紧密相关，部分需通关一周目后才能触发捕捉条件，且多数具有独特的战斗机制